长期便秘得做粪便检查、结肠镜检查以及胃肠传输试验。粪便检查能够查看粪便的外形、色泽、构成成分等，以此来确认是否存在潜血，或是有没有寄生虫这类异常状况，借由这个检查，初步判定肠道有没有病变。结肠镜检查相当重要，医生可以直接看清直肠、结肠等肠道内部的情形，肠黏膜有没有发炎、长息肉或者出现肿瘤，统统都能被发现。胃肠传输试验重点在于利用X光等手段追踪标记物在肠道里的位置，进而判断肠道的蠕动功能有无问题。
